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點(diǎn)擊次數(shù):17285 發(fā)布時(shí)間:2012/9/18 15:30:01
:plko.1-trc克隆載體
財(cái)團(tuán)的干擾
1的plko。克隆載體骨干,技術(shù)聯(lián)盟(券)建了一個(gè)圖書(shū)館的發(fā)夾針對(duì)15000人和15000小鼠基因。addgene正與真相與和解委員會(huì)使這個(gè)狀克隆載體提供給科學(xué)界。請(qǐng)舉北陸等人。,2006月;124(6):1283-98(醫(yī)學(xué))在所有出版物引起使用這種載體。
1 plko數(shù)碼地圖。
plko。1是一個(gè)不稱職的慢病毒載體選擇的真相與和解委員會(huì)表達(dá)發(fā)夾。plko。1可引入細(xì)胞通過(guò)直接轉(zhuǎn)染,或可轉(zhuǎn)換成慢粒子隨后感染的靶細(xì)胞系。一經(jīng)推出,嘌呤霉素抗性標(biāo)記編碼plko 1允許方便穩(wěn)定的選擇。
圖1:圖1 plko含有狀插入。原plko.1-trc克隆載體有一1.9kb填充物是由消化上井和限制性。狀核苷酸克隆到上井和限制性網(wǎng)站中的填充物。在上井現(xiàn)場(chǎng)銷毀在大多數(shù)情況下(取決于靶序列),而限制性網(wǎng)站保存。一個(gè)完整的地圖plko。1載1.9kb填塞,訪問(wèn)www.addgene.org/10878。
描述向量元素
U 6人U 6啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)聚合酶轉(zhuǎn)錄三代狀記錄。
cppt中央polypurine道,cppt,改善傳導(dǎo)效率,促進(jìn)核進(jìn)口的載體”的國(guó)家的復(fù)雜的細(xì)胞的轉(zhuǎn)。
hpgk人力磷酸激酶啟動(dòng)子驅(qū)動(dòng)表達(dá)嘌呤。
嘌呤霉素抗性基因選擇是選擇plko 1質(zhì)粒在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中。
3 ''ltr 3 ' '鈍長(zhǎng)末端重復(fù)。
F1山F1細(xì)菌復(fù)制的起源。
安培的氨芐青霉素抗性基因選擇plko 1質(zhì)粒在細(xì)菌細(xì)胞。
市局山市局細(xì)菌復(fù)制的起源。
5 ''ltr 5 '長(zhǎng)末端重復(fù)。
債轉(zhuǎn)速反應(yīng)元件。
圖2:細(xì)節(jié)狀插入。該U 6啟動(dòng)子指導(dǎo)核糖核酸轉(zhuǎn)錄聚合酶三狀。狀包含21個(gè)“意義”的基礎(chǔ)是相同的目標(biāo)基因,一個(gè)環(huán)包含一個(gè)xhoi限制的網(wǎng)站,和21的“反”的基礎(chǔ),是相輔相成的“意義”基地。狀其次是polyt終止序列聚合酶三。
. 3的相關(guān)產(chǎn)品
以下質(zhì)?從addgene建議使用與plko 1 trc-cloning向量。
質(zhì)粒(addgene身份#)描述
plko。1 -真相與和解委員會(huì)的控制(10879)陰性對(duì)照載體插入發(fā)夾。
plko。1 -爭(zhēng)奪狀(1864)陰性對(duì)照載體炒狀。
pspax2(12260)包裝質(zhì)粒生產(chǎn)病毒顆粒。
pmd2。克(12259)信封質(zhì)粒生產(chǎn)病毒顆粒。
注:plko。1也可以用來(lái)與包裝質(zhì)粒和pcmv-dr8.2(addgene # 8455)和包膜質(zhì)粒pcmv-vsvg(addgene # 8454)從羅伯特溫伯格的實(shí)驗(yàn)室。更多信息,訪問(wèn)addgene '的哺乳動(dòng)物干擾工具頁(yè)。
其他幾個(gè)實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)plko衍生載體,也可能是有用的實(shí)驗(yàn)。看到這些載體,訪問(wèn)addgene '的網(wǎng)站和搜索”plko”。
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B .設(shè)計(jì)為1 plko狀寡核苷酸。
B . 1確定*佳21濱海目標(biāo)在你的基因
選擇合適的21濱海目標(biāo)基因的步是有效的基因沉默。方法選擇目標(biāo)的不斷提高。以下是建議為目標(biāo)的選擇。
1。使用中的選擇工具來(lái)確定一組得分的目標(biāo),你的基因。例如,懷特海生物醫(yī)學(xué)研究所主辦了一個(gè)基因選擇程序,可以訪問(wèn)后,免費(fèi)注冊(cè)(網(wǎng)址:/ /侏羅。我。麻省理工學(xué)院。”/ bioc / sirnaext /)。如果你有機(jī)會(huì),另一個(gè)很好的程序irnai,這是免費(fèi)提供的公司mekentosj(網(wǎng)址:http : / / / www.mekentosj。irnai /)。
總結(jié)準(zhǔn)則設(shè)計(jì)的siRNA與有效的基因沉默是包含在這里:
從25nt下游的起始密碼子(球蛋白),搜索21nt序列匹配模式機(jī)管局(n19)。如果沒(méi)有合適的匹配,搜索納爾(*新)ynn,沒(méi)有任何核苷酸,是嘌呤(一,克),并是一個(gè)嘧啶(丙,你)。
氣相色譜法的內(nèi)容應(yīng)該是36-52 %。
3’端應(yīng)具有較低的穩(wěn)定性–至少一一或之間的位置- 19。
避免針對(duì)內(nèi)含子。
避免的4個(gè)或多個(gè)核苷酸重復(fù),尤其是因?yàn)?/span>重復(fù)polyt是終止信號(hào)的核糖核酸聚合酶三。
2。減少退化的目標(biāo)基因,利用美國(guó)的高爐項(xiàng)目。選擇序列,至少有3個(gè)核苷酸錯(cuò)配的所有基因無(wú)關(guān)。
addgene建議你選擇多目標(biāo)序列為每個(gè)基因。一些序列將乙
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